新一代測(cè)序引入的誤差,使得我們很難檢測(cè)到罕見(jiàn)變異,而這些罕見(jiàn)變異在癌癥等疾病中發(fā)揮著重要的作用。
我公司研究人員,在對(duì)2400個(gè)人的外顯子組進(jìn)行測(cè)序和分析之后推斷,大多數(shù)單核苷酸變異是罕見(jiàn)的,在樣本群體中的發(fā)生率小于0.5%。這一發(fā)現(xiàn)解釋了為什么全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)——試圖將常見(jiàn)遺傳變異與特定疾病表型起來(lái)——對(duì)于復(fù)雜疾病通常是失敗的。
研究人員指出:“這些罕見(jiàn)突變真的是重要的。我們不傾向于在常見(jiàn)變異中尋找特定疾病的風(fēng)險(xiǎn)變異,因此很顯然,所有的罕見(jiàn)變異在一起,的確引發(fā)了許多疾病表型,因此我們需要研究它們。"
雖然新一代DNA測(cè)序?qū)膊∠嚓P(guān)突變的檢測(cè)和個(gè)性化醫(yī)學(xué)發(fā)展,具有很大的潛力,但是我們檢測(cè)罕見(jiàn)變異的能力,因樣本制備、測(cè)序和分析步驟過(guò)程中引入的誤差而受到限制。因此,大約1%的堿基是錯(cuò)誤識(shí)別的。
雖然這種誤差率對(duì)于某些應(yīng)用是可以接受的,但是它已經(jīng)成為癌癥研究人員的一個(gè)主要障礙。所以現(xiàn)在,研究人員正在開(kāi)發(fā)新的技術(shù),以準(zhǔn)確地識(shí)別基因組大海中的罕見(jiàn)變異。